农村房屋产权登记的程序是：

1、申请。

申请是指权利人因设定房屋产权而向房屋所在地的县级房屋登记机关要求进行登记的行为。申请人可以是自然人，也可以是法人或者其他组织。申请人为法人、其他组织的，应当使用其法定名称，由其法定代表人申请。申请人为自然人的，应当使用其身份证件上的姓名。申请人进行申请房屋产权登记，既可以由权利人自己申请登记，也可以委托代理人申请房屋产权登记。共有的房屋，由共有人共同申请。房屋他项权利登记，由权利人和他项权利人共同申请。申请人申请登记时，应当向登记机关交验单位或者相关人的有效证件。代理人申请登记时，除向登记机关交验代理人的有效证件外，还应当向登记机关提交权利人的书面委托书。

2、受理。

受理是指房屋登记机关接受权利人的请求而对权利人所提交的相关资料进行形式审查的行为。申请人对所提交的资料的实质性内容负责。资料齐备，形式合法的，登记机关予以受理，发给申请人受理通知书。资料不齐备，形式欠缺的，登记不予受理，发给申请人不予受理通知书，并说明不予受理的理由。

3、调查。

登记机关对申请人的申请进行实质审查，查明房屋的客观现状的行为。房屋的客观现状包括房屋所使用土地的宗地界线、宗地面积、房屋的座落位置、房屋结构和房屋建筑面积。登记机关对予以受理的请求应及时指派两人以上工作人员进行实地调查，并画测绘图。

4、公告。

公告是指房屋登记机关在对申请人所提供的资料进行形式审查和实质审查后，以一定的方式向公众公布欲予核准房屋产权的有关事项，利害关系人可以在规定的期限内向房屋登记机关提出异议。公告的形式应让社会公众方便获知。公告应保留合理的期限，一般应为30天。利害关系人可以是自然人、法人、其他社会组织，也可以是有关国家机关。公告期满，没有异议的，应向申请人核发房屋所有权证书。利害关系人提出异议的，利害关系人应提供相应的证据。

5、听证。

房屋登记机关因利害关系人在公告期内对房屋登记机关公布的欲予核准房屋产权的有关事项提出异议，应组织听证。申请人和利害关系人进行对质，查明有关事实真相。登记机关做好听证记录。听证程序并不是房屋登记的必经程序，它因利害关系人有相应的证据资料，向房屋登记机关提出异议，房屋登记机关认为确有必要时，才启动听证程序。

6、决定。

房屋登记机关对申请人所提交的文件资料进行形式审查和实质审查，认为 申请人提交的文件资料齐全、有效，土地房屋权属来源合法、明确，登记机构应当决定予以核准登记，给权利人颁发房屋产权证书。申请人因正当理由不能按期提交证明材料的;或按照规定需要补办手续的;或法律、法规规定可以准予暂缓登记的。经申请人申请可以决定准予暂缓登记。对房屋属于违章建筑的或临时建筑的;或法律、法规规定的其他情形的，房屋登记机关应当作出不予登记的决定，并向申请人书面说明理由。

7、归档。

农村房屋登记机关应将房屋产权登记有关资料整理归档，妥善保管，方便查阅。

解决农村房屋产权纠纷，可以通过协商、调解、仲裁、行政和诉讼等办法加以解决。

1、协商解决。

2、调解解决。

调解，是指农村房屋产权纠纷双方，在不能通过相互协商解决纠纷时，根据一方当事人的申请，在有关部门的主持下，通过说服教育，促使双方当事人相互谅解，达成和解协议，使购房纠纷及时得到解决的一种方式。

3、仲裁解决。

仲裁又称公断，是指农村房屋产权纠纷双方在争议发生之前或争议发生后达成协议，自愿将争议交给仲裁机关依照国家法律、法规和地方性行政规章、规定做出对各方均具有约束力的裁决。仲裁不受行政机关、社会团体和个人的干预，仲裁委员会与行政机关之间没有隶属关系。仲裁裁决一经做出，即具有法律效力，并且仲裁裁决是终局的，不存在当事人上诉的问题。

4、诉讼解决。

人民法院在纠纷当事人和其他诉讼参与人的共同参加下，解决农村房屋产权纠纷的一种方式。

案件回顾：

当事人马某原为城镇居民。1989年，马某和陈某签署房屋买卖合同，陈某将位于北京市海淀区海淀乡肖家河的农村房卖与马某，价款21000元。双方买卖行为发生后，马某向有关部门交纳了相应契税，取得了相关审批，并于1996年取得北京市房地产管理局颁发的房产所有证。此后，马某又于2005年将户口迁入诉争房屋。但陈某认为根据我国法律规定，农村宅基地不得向城市居民出售，双方签订的房屋买卖合同违反了国家法律规定，故于2007年向一审法院起诉要求确认双方签订的房屋买卖合同无效，并要求马某腾退房屋。一审法院经审理后认为，因诉争房屋之宅基地属当地农村集体所有，马某属城镇居民购买农村房屋，虽签订买卖合同当时系双方自愿，且马某购买后在院内增建了房屋居住至今，然地上房屋买卖必然涉及土地使用人之变化，故亦不能排除此房屋买卖违反法律法规之性质。此外，因马某坚持双方房屋买卖协议有效，且未提起反诉，故房屋买卖协议无效给马某造成的损失，马某可以另行主张赔偿。最终，一审法院判决：双方于1989年签订的买卖合同无效，马某于判决生效后一个月内腾退诉争房屋，陈某于判决生效后十日内返还马某购房款二万二千元。一审判决后，马某提出上诉。

法院判决：

二审法院经审理认为，按照我国法律规定，农村宅基地的所有权属于农民集体所有，宅基地使用权人在对宅基地行使收益和处分权利时，应当受到严格的限制。在此前提下，城市居民购买农村房屋的行为一般应当认定为无效。但在处理具体案件时应当结合个案的不同情况综合加以判断。本案中，马某作为城市居民，其与陈某签订的房屋买卖合同已经过海淀区乡政府的批准。此后，马某取得了该房屋的产权证书，并已于2005年将户口迁入。在十几年的时间内，马某在诉争房屋中实际居住，已对该房屋形成了稳定的占有关系。鉴于此，在综合案件当时的历史背景及从有利于维护现有的房屋占有关系角度考虑，应该以确认马某与陈某签订的买卖合同有效为宜。据此，二审法院作出撤销原审判决，驳回陈某诉讼请求的终审判决。